Начинали работу на Саяно-Шушенской ГЭС. Это были и пескоструйные, антикоррозийные работы, изготовление и монтаж рыбных линий, прокладка трубопроводов и демонтаж временных зданий. С 2000 года Руководство РАО ЕЭС России приняло решение о достройке «Бурейской ГЭС».
2002 год ознаменовался началом монтажа гидроагрегатов. Все 6 гидроагрегатов «Бурейской ГЭС» были приняты в эксплуатацию с отличным качеством. Именно работой на «Бурейской ГЭС»  закрытое акционерное общество «Енисей-СпецГЭМ» зарекомендовало себя в системе энергетики, как предприятие с грамотными специалистами, способными выполнять любые сложные работы. Одно то, что тысячетонные конструкции устанавливаются с точностью до сотых долей миллиметров, говорит само за себя.
Самым главным богатством организации являются специалисты, за плечами многих из них десятки гидроагрегатов, смонтированных в период строительства гидроэлектростанций при Советской власти.

С 2007 по 2009 год «ЕнисейСпецГЭМ» монтировали гидроагрегаты на «Сангтудинской ГЭС-1» в Республике Таджикистан. Включение в энергосистему Таджикистана четырех гидроагрегатов « Сангтудинской ГЭС-1», смонтированных специалистами «Енисей-СпецГЭМ», сняло напряжение в Республике в нехватке электроэнергии. Руководство Республики Таджикистан очень тепло отзывается о работе наших специалистов.
С 2009 по 2014 год «Енисей-СпецГЭМ» принял участие и вышел победителем в конкурсе на выполнение работ по монтажу гидросилового оборудования девяти комплектов гидроагрегатов «Богучанской ГЭС», Ангарского каскада.
«Саяно-Шушенская ГЭС» — это особый объект в работе «Енисей-СпецГЭМ». С первых часов аварии на ГЭС в 2009 году, «Енисей-СпецГЭМ» активно работал, разбирал завалы, демонтировал поврежденные конструкции, оборудование. Были смонтированы и успешно сданы в эксплуатацию 5 гидроагрегатов.
С 2013 по 2017 год монтаж гидросилового и вспомогательного оборудования 3х гидроагрегатов «Нижне-Бурейской ГЭС».
С 2018 по 2020 год выполнен комплекс работ по проведению капитального ремонта 2х гидроагрегатов «Светлинской ГЭС», республика Саха (Якутия).
С 2016 по 2022 «Енисей-СпецГЭМ» выполнен весь комплекс строительно-монтажных работ с расширением камеры рабочего колеса и шахты генератора по проекту «Комплексная замена гидроагрегатов ст.№1,3,5 Рыбинской ГЭС».
В декабре 2022 года организация отметила своё двадцатипятилетие.